伯努利样品和伯努利pmf的图密度直方图

时间:2020-08-28 11:18:19

标签: python matplotlib scipy statistics bernoulli-probability

问题摘要:

为什么我的样本密度与pmf如此不同,我如何执行此模拟以使pmf和样本估计值相似。

问题:

我使用scipy模拟了独立的伯努利试验的样本。我现在尝试获取我创建的样本的密度直方图,并将其与pmf(概率质量函数)进行比较。我希望密度直方图显示两个bin,每个bin都徘徊在pmf附近,但我在5的pmf值上方有2个bin。请问有人可以告诉我如何创建对Bernoulli不这样做的密度直方图吗?我尝试了一些其他发行版的类似仿真,但似乎效果很好。我在这里想念的是什么?您能告诉我如何操纵我的代码来完成这项工作吗?

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.stats as stats

trials = 10**3
p = 0.5


sample_bernoulli = stats.bernoulli.rvs(p, size=trials) # Generate benoulli RV
plt.plot((0,1), stats.bernoulli.pmf((0,1), p), 'bo', ms=8, label='bernoulli pmf')

# Density histogram of generated values
plt.hist(sample_bernoulli, density=True, alpha=0.5, color='steelblue', edgecolor='none')
plt.show()

enter image description here

如果这是一个简单或琐碎的问题,我必须道歉,但我找不到在线解决方案,却发现这个问题很有趣。任何帮助将不胜感激。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

原因是plt.hist主要用于连续分布。如果不提供明确的bin边界,则plt.hist只会在最小值和最大值之间创建10个等距的bin。这些垃圾箱大多数将是空的。在只有两个可能的数据值的情况下,应该只有两个bin,所以有3个边界:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.stats as stats

trials = 10**3
p = 0.5

sample_bernoulli = stats.bernoulli.rvs(p, size=trials) # Generate benoulli RV
plt.plot((0,1), stats.bernoulli.pmf((0,1), p), 'bo', ms=8, label='bernoulli pmf')

# Density histogram of generated values
plt.hist(sample_bernoulli, density=True, alpha=0.5, color='steelblue', edgecolor='none', bins=np.linspace(-0.5, 1.5, 3))
plt.show()

example plot

这是默认箱边界以及样本如何放入箱的可视化。请注意,使用density=True,对直方图进行了归一化处理,以使所有条形的面积总和为1。在这种情况下,两个条形的宽度为0.1,高约5.0,而其他8条具有高度为零。因此,总面积为2*0.1*5 + 8*0.0 = 1

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.stats as stats

trials = 10 ** 3
p = 0.5

sample_bernoulli = stats.bernoulli.rvs(p, size=trials)  # Generate benoulli RV

# Density histogram of generated values with default bins
values, binbounds, bars = plt.hist(sample_bernoulli, density=True, alpha=0.2, color='steelblue', edgecolor='none')
# show the bin boundaries
plt.vlines(binbounds, 0, max(values) * 1.05, color='crimson', ls=':')
# show the sample values with a random displacement
plt.scatter(sample_bernoulli * 0.9 + np.random.uniform(0, 0.1, trials),
            np.random.uniform(0, max(values), trials), color='lime')
# show the index of each bin
for i in range(len(binbounds) - 1):
    plt.text((binbounds[i] + binbounds[i + 1]) / 2, max(values) / 2, i, ha='center', va='center', fontsize=20, color='crimson')
plt.show()

showing bin boundaries