我有一个这样记录的诊断列表:
df = pd.DataFrame({
"DiagnosisTime": ["2017-01-01 08:23:00", "2017-01-01 08:23:00", "2017-01-01 08:23:03", "2017-01-01 08:27:00", "2019-12-31 20:19:39", "2019-12-31 20:19:39"],
"ID": [1,1,1,1,2,2]
})
ID
可以识别多个主题。对于每个受试者,可能会有一个或多个诊断。每个诊断都可以包含多个条目(因为要对多个事物进行重新记录(在此示例中不包含))。
DiagnosisTime
可以(在某种程度上)标识单个诊断(具有多行)。但是,有时一种诊断的数据写入过程中会有一点延迟,因此在按DiagnosisTime
分组时,我希望允许几秒钟的较小容差。
在此示例中,我希望得到如下结果:
ID
的诊断有两种:1,第0、1、2和第3行。请注意,第2行的DiagnosisTime
与0和1略有不同。ID
2是包含1个诊断,包含第4行和第5行。
对于每个ID
,我想将计数器设置回1(如果更简单,则设置为0)。
这是我走了多远:
df["DiagnosisTime"] = pd.to_datetime(df["DiagnosisTime"])
df["diagnosis_number"] = df.groupby([pd.Grouper(freq='5S', key="DiagnosisTime"), 'ID']).ngroup()
我认为我已经成功地在一个ID
(不是完全确定石斑鱼)中确定了诊断,但是我不知道如何重置计数器。
如果这不可能,那么我将对一个函数返回一个ID
且该组中diagnosis_number
最低的所有记录感到满意。
答案 0 :(得分:1)
您可以使用GroupBy.transform
和factorize
添加lambda函数:
df["diagnosis_number"] = (df.groupby('ID')['diagnosis_number']
.transform(lambda x: pd.factorize(x)[0]) + 1)
print (df)
DiagnosisTime ID diagnosis_number
0 2017-01-01 08:23:00 1 1
1 2017-01-01 08:23:00 1 1
2 2017-01-01 08:23:03 1 1
3 2017-01-01 08:27:00 1 2
4 2019-12-31 20:19:39 2 1
5 2019-12-31 20:19:39 2 1