Question

我想在第一个冒号:（包括）之后删除文本，或者将其替换为空。

例如，1:5:30应更改为1。我更喜欢使用awk脚本来完成这项工作。但我不知道该怎么做。你能告诉我任何指示吗？提前谢谢。

我的数据以制表符分隔，文件看起来像某些单元格中有点。

1       313     .       T       C       30.11        1:5:30  .       .       .
1       316     .       A       T       30.80        1:5:30  .       0:8:28  .
1       317     .       T       A       31.40        1:5:36  .       0:8:28  .

我尝试了以下内容，但是我对所有这些都失败了：

sed 's/:*:*//g' mydatafile
sed 's/:[0-9]:[0-9]//g' mydatafile

Answer 1

有点不清楚所需的输出应该是什么，但这是我的解释，使用sed：

$ sed 's/:.*//' input
1   313 .   T   C   30.11   1
1   316 .   A   T   30.80   1
1   317 .   T   A   31.40   1

使用awk：

$ awk -F":" '{print $1}' input
1   313 .   T   C   30.11   1
1   316 .   A   T   30.80   1
1   317 .   T   A   31.40   1

使用剪切：

cut -d":" -f1 input

使用bash：

IFS=':'

while read a b; do
    echo $a
done < input

使用awk的替代解释：

$ awk 'BEGIN {OFS="\t"} {sub(/:.*/,"",$7); print}' input
1   313 .   T   C   30.11   1   .   .   .
1   316 .   A   T   30.80   1   .   0:8:28  .
1   317 .   T   A   31.40   1   .   0:8:28  .

第3次，希望最后一次更新

使用awk进行第3次解释：

$ awk 'BEGIN {OFS="\t"} {for (i=1;i<NF;i++){sub(/:.*/,"",$i)}; print}' input
1   313 .   T   C   30.11   1   .   .   .
1   316 .   A   T   30.80   1   .   0   .
1   317 .   T   A   31.40   1   .   0   .

Answer 2

perl -p -e 's/:\d+:\d+//g' mydatafile

Answer 3

试试这个：

sed 's/\([0-9][0-9]*\):[0-9][0-9]*:[0-9][0-9]*/\1/g' infile

或

sed 's/\([0-9]\{1,\}\):[0-9]\{1,\}:[0-9]\{1,\}/\1/g' infile

<强>输出：

1       313     .       T       C       30.11        1  .       .       .
1       316     .       A       T       30.80        1  .       0  .
1       317     .       T       A       31.40        1  .       0  .

Answer 4

这是使用sed的最短的一个：

sed -i.orig 's/\([0-9]\)*:[^ ]*/\1/g' inputfile

这会将原始文件的副本保留为inputfile.orig。并就地替换文件。

Answer 5

这应该可以解决问题。

$ sed -e 's/:.*//' mydatafile
1       313     .       T       C       30.11        1
1       316     .       A       T       30.80        1
1       317     .       T       A       31.40        1

我认为sed比awk更容易解决这个问题。

Overview of Regular Expression Syntax

后来。。

我从您的评论中看到您希望将{{1>}的x:y:z替换为<{1}}的其他答案。在那种情况下，我会使用这个awk程序。

如何使用awk修改文本字段？

5 个答案: