如何使用sed或awk修改文本

Question

我想转换此文件

hg19_ct_UserTrack_3545_12805 range=chr1:117217481-117217677 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
TCCTCATGAGTTTACATTCTTTATTAGTTTCTCTGTTTATGGTCATCTTC
CCCTGGGTATGTAAGCTGTCTGTGGGCTGGAATCTGGTCTGTCTTGTTCT
CTGGTGTTGGTCCAATGCCTAGAATAATGCCTAGCACATAGGATGTGATC
AACAAATATTTGTTGAATGAATACGTTCTAGTTGGAAAGACAATAAA .... etc

到

range=chr1:117217481-117217677 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
TCCTCATGAGTTTACATTCTTTATTAGTTTCTCTGTTTATGGTCATCTTC
CCCTGGGTATGTAAGCTGTCTGTGGGCTGGAATCTGGTCTGTCTTGTTCT
CTGGTGTTGGTCCAATGCCTAGAATAATGCCTAGCACATAGGATGTGATC
AACAAATATTTGTTGAATGAATACGTTCTAGTTGGAAAGACAATAAA .... etc

我一直在尝试awk并且没有运气。

Answer 1

您只需要从第一行删除hg19_ct_UserTrack_3545_12805吗？

然后尝试：

awk 'NR==1{sub(/^[^ ]* /,"")}1' file

Answer 2

由于这是一个简单的替换，我会使用sed：

$ sed '1s/\w\+ //' file
range=chr1:117217481-117217677 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
TCCTCATGAGTTTACATTCTTTATTAGTTTCTCTGTTTATGGTCATCTTC
CCCTGGGTATGTAAGCTGTCTGTGGGCTGGAATCTGGTCTGTCTTGTTCT
CTGGTGTTGGTCCAATGCCTAGAATAATGCCTAGCACATAGGATGTGATC
AACAAATATTTGTTGAATGAATACGTTCTAGTTGGAAAGACAATAAA

说明：

1   # First line only
s/  # Subsitution 
\w+ # Match one or more word character follow by a space
/   # Replace with
/   # Nothing

默认情况下，sed会打印到stdout，但您可以使用-i选项直接将更改保存到文件：sed -i '1s/\w\+ //' file。