使用深CNN和完全连接的分类器转换分割蒙版numpy数组以进行图像分割

Question

我正在按照Pereira等人的论文建立医学图像分割模型，他们使用卷积网络将其输入到完全连接的分类器中。 我想从正常组织中切除肿瘤。

我目前有一个numpy数组，包含预先分割的图像[0] =背景[1] =肿瘤，形状为443、443、1作为“目标”，形状为443、443、1的图像作为输入。

如何获取模型以对原始图像的补丁进行分类，然后在最后重建整个图像以生成分割图？

谢谢！

Answer 1

如果您参考论文“ Brain Tumor Segmentation Using ConvolutionalNeural Networks in MRI Images”，他们会从原始MRI扫描中提取大小为33x33像素的斑块，并将每个斑块归为5类（正常组织，坏死，水肿，增强或增强肿瘤），以中间像素的类别为基础。

最后，您从一个MRI图像中分别对每个面片进行分类，并跟踪其坐标以建立分割图。