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我从seurat rds文件中制作了一个cds文件,以便使用monocle3进行伪时间分析。 我可以在seurat簇上得到单片轨迹图。
同时,我想用cds数据制作一个系统进化树,因为很容易看到我的细胞的二分谱系。
在单片眼镜2中有一个函数“ plot_complex_cell_trajectory”。但是,在单片眼镜3中不能使用此功能。
如果有人可以为此提供解决方案,将是感激的!
谢谢!
Juhee