我非常渴望install.packages("devtools")
。
但是它始终会因该错误而失败
Error: .onLoad failed in loadNamespace() for 'pkgload', details:
call: readRDS(nsInfoFilePath)
error: error reading from connection
Execution halted
ERROR: lazy loading failed for package ‘devtools’
* removing ‘/home/bjoern/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/devtools’
我试图解决的问题:
dependencies = T
参数install.packages("pkgload")
会导致几乎完全相同的错误(请参见下文)install.packages(“ pkgload”)错误
Error: package or namespace load failed for ‘pkgload’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'pkgload', details:
call: readRDS(nsInfoFilePath)
error: error reading from connection
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
我更深入地研究了pkgload(至少我希望这是造成问题的唯一原因)。我将检查是否手动(重新)安装所有导入,并建议从pkgload的CRAN页面中解决该问题。
导入:desc,方法,pkgbuild,rlang,rprojroot,rstudioapi, utils,withr
建议: bitops,covr,Rcpp,testthat
sessionInfo()
输出:
R version 3.6.3 (2020-02-29)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 20.04 LTS
Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.9.0
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.9.0
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=de_DE.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=de_DE.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=de_DE.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=de_DE.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.3 tools_3.6.3
我仍然不相信在ubuntu20上安装devtools是不可能的
但是在这一点上,我会吸着稻草
简而言之,为我解决的问题是之前安装了testthat软件包。感谢rui-barradas
的评论install.packages("testthat")
install.packages("pkgload")
install.packages("devtools")
答案 0 :(得分:4)
我也在Ubuntu 20.04上,但运行的是R 4.0.0。
当尝试安装软件包时,如果它依赖于R 4.0.0之前安装的另一个软件包,则会收到错误消息,并且安装失败。即使我在对dependencies = TRUE
的呼叫中设置了install.packages
,也会发生这种情况。
示例:命令是
install.packages('pkgload')
我省略了第一行输出,说文件已下载。然后,相关部分。
- 正在安装 source 软件包“ pkgload” ...
的延迟加载失败
**软件包“ rcmdcheck”已成功解压,并检查了MD5总和
**使用分阶段安装
** R
**进行字节编译并准备用于延迟加载的软件包错误:R 4.0.0之前安装的软件包“ testthat”:请重新安装
执行停止错误:“ pkgload”包- 删除“ / usr / local / lib / R / site-library / pkgload”
- 在install.packages中恢复先前的“ / usr / local / lib / R / site-library / pkgload”警告:安装了软件包“ pkgload” 非零退出状态下载的源包位于
‘/ tmp / RtmpVxpbs0 / downloaded_packages’
正确的方法。
安装软件包pkgload
的正确方法是运行序列
install.packages('testthat')
install.packages('pkgload')
问题已解决。
注意,对于其他软件包,已经碰巧看到这是一个递归问题。想象一下,软件包testthat
依赖于(不是)依赖于R 4.0.0之前安装的另一个软件包。
烦人但可以解决。
sessionInfo()
#R version 4.0.0 (2020-04-24)
#Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#Running under: Ubuntu 20.04 LTS
#
#Matrix products: default
#BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.9.0
#LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.9.0
#
#locale:
# [1] LC_CTYPE=pt_PT.UTF-8 LC_NUMERIC=C
#[3] LC_TIME=pt_PT.UTF-8 LC_COLLATE=pt_PT.UTF-8
# [5] LC_MONETARY=pt_PT.UTF-8 LC_MESSAGES=pt_PT.UTF-8
# [7] LC_PAPER=pt_PT.UTF-8 LC_NAME=C
# [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
#[11] LC_MEASUREMENT=pt_PT.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#
#attached base packages:
#[1] stats graphics grDevices utils datasets
#[6] methods base
#
#other attached packages:
#[1] rvest_0.3.5 xml2_1.3.2 data.table_1.12.8
#
#loaded via a namespace (and not attached):
答案 1 :(得分:1)
我遇到了同样的问题,并且至少在我的情况下,解决方案是Ubuntu 20.04.1 LTS(Focal Fossa)+ R 4.0.2:
首先(从终端)安装:
步骤1:sudo apt-get update -y
步骤2:sudo apt-get install -y libxml2-dev
然后从RStudio(首先设置setRepositories,然后选择8个存储库)并安装两个软件包:
安装xml2软件包
安装devtools
为我工作。