具有带有heatmap.2（）函数的两个不同颜色键的热图

Question

Blockquote

我试图弄清楚如何使用两个不同的颜色键获取热图：一个用于我的值（属于矩阵“ df1”的第一和第二列），另一个用于我的pvalue（由以下值确定）第一列与第二列之间的差异）。我总共有50种不同的观察结果（50行3列）。 有人知道如何用不同的颜色图绘制pvalue列吗？

这是我的代码的样子：

df1<-as.matrix(df)
yb<-colorRampPalette(c("lightcyan","darkblue", "red"))
heatmap.2(df1,
      trace=NULL,         
      margins = c(2,20),
      colsep = c(1,2,3),
      col=yb,
      tracecol = NULL,
      key.title = NA,
      cexCol = 1,
      srtCol = 0,
      adjCol = 1,
      sepcolor="black",
      sepwidth=c(0.0001,0.001),
      rowsep=1:nrow(df1),
      Colv = FALSE,
      keysize = 1,
      key.xlab = "Normalized plaques count",
      key.ylab = NA)

Answer 1

我不确定这是否是heatmap2的预期用途-看来您确实需要两个不同的图。一个图中的值和另一个图中的p值。您将需要自定义代码（我想将它们组合在一起）（无论如何严格来说这是不正确的），我怀疑这会带来更多麻烦，而不是值得的。除非您打算产生很多这样的东西，否则在图形编辑器中更容易一些东西。