我有一个值数组t,它总是按递增的顺序(但不总是均匀间隔)。我有另一个单值x。我需要在t中找到索引,使得t [index]最接近x。该函数必须为x< t.min()和x>的最大索引(或-1) t.max()。
我写了两个函数来做到这一点。在这个简单的定时测试中,第一个f1更快。但我喜欢第二个只是一行。此计算将在大型阵列上完成,可能每秒多次。
任何人都可以提出一些其他功能,与第一个功能相当,但代码更清晰吗?比第一个更快的东西怎么样(速度最重要)?
谢谢!
代码:
import numpy as np
import timeit
t = np.arange(10,100000) # Not always uniform, but in increasing order
x = np.random.uniform(10,100000) # Some value to find within t
def f1(t, x):
ind = np.searchsorted(t, x) # Get index to preserve order
ind = min(len(t)-1, ind) # In case x > max(t)
ind = max(1, ind) # In case x < min(t)
if x < (t[ind-1] + t[ind]) / 2.0: # Closer to the smaller number
ind = ind-1
return ind
def f2(t, x):
return np.abs(t-x).argmin()
print t, '\n', x, '\n'
print f1(t, x), '\n', f2(t, x), '\n'
print t[f1(t, x)], '\n', t[f2(t, x)], '\n'
runs = 1000
time = timeit.Timer('f1(t, x)', 'from __main__ import f1, t, x')
print round(time.timeit(runs), 6)
time = timeit.Timer('f2(t, x)', 'from __main__ import f2, t, x')
print round(time.timeit(runs), 6)
答案 0 :(得分:7)
这似乎更快(对我来说,Python 3.2-win32,numpy 1.6.0):
from bisect import bisect_left
def f3(t, x):
i = bisect_left(t, x)
if t[i] - x > 0.5:
i-=1
return i
输出:
[ 10 11 12 ..., 99997 99998 99999]
37854.22200356027
37844
37844
37844
37854
37854
37854
f1 0.332725
f2 1.387974
f3 0.085864
答案 1 :(得分:1)
使用searchsorted:
t = np.arange(10,100000) # Not always uniform, but in increasing order
x = np.random.uniform(10,100000)
print t.searchsorted(x)
修改强>
啊,是的,我看到你在f1做的事情。也许下面的f3比f1更容易阅读。
def f3(t, x):
ind = t.searchsorted(x)
if ind == len(t):
return ind - 1 # x > max(t)
elif ind == 0:
return 0
before = ind-1
if x-t[before] < t[ind]-x:
ind -= 1
return ind
答案 2 :(得分:1)
np.searchsorted
是二分搜索(每次将数组拆分为一半)。所以你必须以一种方式实现它,它返回小于x的最后一个值,而不是返回零。
查看此算法(来自here):
def binary_search(a, x):
lo=0
hi = len(a)
while lo < hi:
mid = (lo+hi)//2
midval = a[mid]
if midval < x:
lo = mid+1
elif midval > x:
hi = mid
else:
return mid
return lo-1 if lo > 0 else 0
刚刚替换了最后一行(return -1
)。也改变了论点。
由于循环是用Python编写的,可能比第一个慢...(未经基准测试)