R：在插入符号模型上使用rms :: fastbw进行向后功能选择时出错

Question

我想使用fastbw包中的函数rms执行向后功能选择。我使用以下示例数据集PimaIndiansDiabetes：

library(mlbench)
data(PimaIndiansDiabetes)

library(caret)
trControl <- trainControl(method = "repeatedcv",
                          repeats = 3,
                          classProbs = TRUE,
                          number = 10, 
                          savePredictions = TRUE,
                          summaryFunction = twoClassSummary)

caret_model <- train(diabetes~., 
                     data=PimaIndiansDiabetes, 
                     method="glm", 
                     trControl=trControl)

library(rms)
reduced_model <- fastbw(caret_model$finalModel)

这给了我一个错误：

  

fastbw（caret_model $ finalModel）中的错误：适合没有设计   信息

我可以知道这是什么意思以及如何解决吗？

Answer 1

您可能被困住了。 fastbw()仅适用于rms中的模型，即?fastbw说：

  

fit：适合定义了“ Varcov（fit）”的对象（例如，来自“ ols”，             “ lrm”，“ cph”，“ psm”，“ glmD”）

我尝试使用method="lrm"适合您（lrm是rms的逻辑回归工具），但是得到了

  

错误：模型lrm不在插入符号的内置库中

我认为您将不得不寻找另一种逐步回归的方法，例如请参见this question：即先使用library(MASS)，然后再使用method="glmStepAIC"（在caret之内）或stepAIC（从头开始）。

对于我来说，为什么训练模型然后逐步逐步回归...