用纸厂执行Jupyter笔记本并输出唯一的文件名

时间:2019-11-27 17:03:47

标签: python bash jupyter-notebook papermill

我想将papermill用作数据科学工作流程的一部分来记录实验。关键思想是,输出笔记本应作为唯一的工件存储-实验的不变记录。因此,我希望输出文件名是唯一文件名,例如experiment_<hash>.ipynb。如何在Linux CLI上自动执行此操作?从papermill文档中,看来我必须指定确切的输出文件名,如

papermill local/input.ipynb s3://bkt/output.ipynb -f parameters.yaml

而我真正想要的是类似的东西

papermill local/input.ipynb s3://bkt/output_[UNIQUE HASH HERE].ipynb -f parameters.yaml

我想在papermill呼叫中自动进行此操作

$ echo cat input.ipynb | md5sum
22f69c25ee3a855b17fead21e702668a
$ papermill local/input.ipynb s3://bkt/output_22f69c25ee3a855b17fead21e702668a.ipynb -f parameters.yaml

但是我不想通过剪切和粘贴手动完成。

1 个答案:

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您可以使用命令替换,例如:

papermill local/input.ipynb s3://bkt/output_`date +%s | sha256sum | base64 | head -c 32`.ipynb -f parameters.yaml

或更新的方式

papermill local/input.ipynb s3://bkt/output_$(date +%s | sha256sum | base64 | head -c 32).ipynb -f parameters.yaml