在bash脚本中处理python错误,没有错误代码

时间:2019-08-14 18:36:03

标签: python bash jupyter-notebook papermill

我正在运行python cli工具Papermill。我正在运行jupyter笔记本,并且希望能够在笔记本运行时检测assertionErrors。当我从bash脚本运行papermill时,即使笔记本中存在python错误,我也总是得到0退出代码。

我发现了一些检测退出代码的方法,这些方法都有效,但是python错误并未抛出任何代码

例如:在我的nbTest.sh中,我正在运行笔记本并寻找错误

papermill python_notebooks/testing/$d python_notebooks/testing/results/$d.results.ipynb || True
if [ $? -eq 0 ]
then
  echo "Successfully executed script"
else
  # Redirect stdout from echo command to stderr.
  echo "Script exited with error." 
fi
done

作为输出,我得到:

.
.
.
Input Notebook:  python_notebooks/testing/paperTest.ipynb
Output Notebook: python_notebooks/testing/results/paperTest.ipynb.results.ipynb
 83%|████████▎ | 5/6 [00:00<00:00,  1.97it/s]
Traceback (most recent call last):
 ...
---------------------------------------------------------------------------
Exception encountered at "In [5]":
---------------------------------------------------------------------------
AssertionError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-5-d941c6663321> in <module>()
----> 1 assert passed == False

AssertionError: 
Successfully executed script

我希望退出代码为1,但无法处理python故障

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

Jupyter和Papermill组合的优点之一是错误被保存在笔记本中以及错误发生的位置。一次运行多个ETL作业时,这非常有用。如果您还想访问笔记本之外的错误,我将从errors.txt内部将特定错误写到try catch文件中。然后,您可以通过读取错误来结束脚本。

讨论了各种错误记录技术in this post