有没有一种方法可以快速访问OWL（RDF / XML）文件中的所有注释和子注释？

Question

所以我有一个在Protege中构建的本体，其中包含注释和子注释。我的意思是，一个概念可能有一个定义，而该定义可能有一个注释。

所以您可能会遇到（s，p，o）：

'http://purl.fakeiri.org/ONTO/1111' --> 'label' --> 'Term'

'Term' --> 'comment' --> 'Comment about term.'

我正在尝试使用Flask应用程序使本体易于探索（我正在使用Python解析本体文件），而且我似乎无法快速获取所有的注释和子注释。

我开始使用owlready2包，但是它要求您自定义每个单独的注释属性（您不能仅获取所有注释属性的列表，因此，如果添加诸如{{1} }，您必须返回代码并添加random_identifier，否则它将不会被提取）。可以，很快，但是子注释需要加载IRI，然后按以下方式搜索它：

entity.random_identifier

这非常慢，加载大约5到10分钟即可搜索大约140种子注释类型，而仅使用注释需要3-5秒。

我决定从此处废弃random_prop = IRIS['http://schema.org/fillerName'] sub_annotation = x[entity, random_prop, annotation_label] 并尝试owlready2。但是，似乎子注释只是作为BNode附加的，我不知道如何通过它们的“父”注释访问它们，或者甚至不可能。

TL; DR：有人知道如何访问一个条目并快速将其所有注释和子注释收集到XML / RDF本体文件中吗？

编辑1：

如所建议的，这是本体的一个片段：

rdflib

非常感谢大家！

Answer 1

从您的问题中我可以得出结论，“子注释”级别只有一个深度。在这种情况下，您可以执行以下SPARQL查询：

SELECT ?annProp ?annValue ?subAnn ?subValue
WHERE { 
   ?annProp a owl:AnnotationProperty .
   <the:concept> ?annProp ?annValue . 
   OPTIONAL { ?annValue ?subAnn ?subValue . }
}

这将检索给定概念the:concept的所有注释属性及其值，并且，可选地，如果该注释具有“子注释”，则还将检索该子注释。

Answer 2

所以我忽略了明显的...我将owlready2从0.18更新为0.22，现在闪电般快了。

Answer 3

“ XPath表达式”（一种将搜索指定为XML结构的方式）可能能够完成工作。

请参阅：

How to use Xpath in Python?

https://docs.python.org/2/library/xml.etree.elementtree.html#xpath-support

如果数据具有XML结构，则XPath可能可以遍历树（为您...）并检索感兴趣的节点。