Snakemake-下载数据的规则

Question

我在实施管道时遇到了一些麻烦，其中第一步是从某些服务器下载数据。据我了解，所有规则都必须具有作为文件的输入。但是，在我的情况下，“输入”是提供给脚本的ID字符串，该脚本访问服务器并下载数据。
我知道snakemake中的remote files选项，但是我要从（ENA）下载的服务器不在该列表中。此外，我正在使用一个调用aspera的脚本来提高下载速度。
关于如何在snakemake中实现这种方案的任何想法？

Answer 1

规则实际上不需要输入字段，因此可以这样：

rule download:
    output:
        "downloads/{sample}.fa"
    shell:
        "ascp ftp:/url_here+{wildcards.sample}"