如何使用R从UniProt下载多重登录?

时间:2019-11-22 19:05:20

标签: r fasta bioconductor

我有UniProt个登录号的庞大列表,我需要从UniProt网站检索FASTA序列。是否有任何R脚本可以做到这一点?我知道我可以从UniProt网站上进行此操作,但这将用于进一步开发用于下游质谱分析的脚本。

我正在使用以下脚本,但显示为

  

getFASTAFromUniProt(c(“ P62754”,“ Q8K094”,“ Q64337”))中的错误:可能   找不到函数“ getFASTAFromUniProt”

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("Rcpi")

library( Rcpi ) 
fastas <- getFASTAFromUniProt( c( "P62754", "Q8K094", "Q64337" ) ) 
write("_uniprot_downloads", "uniprot.fasta" )

0 个答案:

没有答案