我在一个文件夹中有几个BAM文件。这些来自两次运行。这是相同的示例,将具有两个BAM文件。我想选择一个样本的两个BAM文件,并使用samtools合并它们。两个BAM文件的名称的前几个字符相同,但中间不同。合并前如何根据零件通用名称选择两个BAM文件。这是一个需要的输出
AK_TS049_S97_sorted_rdgrp.bam
AK_TS049_sorted_rdgrp.bam
AK_TS1100_S907_sorted_rdgrp.bam
AK_TS1100_sorted_rdgrp.bam
samtools merge AK_TS049_merged.bam AK_TS049_S97_sorted_rdgrp.bam AK_TS049_sorted_rdgrp.bam
samtools merge AK_TS1100_merged.bam AK_TS1100_S907_sorted_rdgrp.bam AK_TS1100_sorted_rdgrp.bam