Question

我正在尝试将几个文件合并为一个，在第一列中添加每个文件的名称。我已经放置了标题和文件名，但是我不希望整个文件名谢谢

#!/bin/sh
for i in *.txt
do
  head -1 $i | awk '{OFS="\t";print "Sample", $0}' > outputprueba.txt
break
done
for a in *bla.txt
do
        sed 1d $a | awk -v x="'"$a"'" '{OFS="\t";print x, $0}' >> outputprueba.txt
done

I expect this output:
Sample  Chr Start   End
File1   chr1    10318652    10318652
File1   chr1    10322054    10322054
File2   chr1    132887500   132887500
File2   chr1    132888208   132888208

but the actual output is:
Sample  Chr Start   End
'File1_annotated_fastq_blablabla.txt'   chr1    10318652    10318652
'File1_annotated_fastq_blablabla.txt'   chr1    10322054    10322054
'File2_annotated_fastq_blablabla.txt'   chr1    132887500   132887500
'File2_annotated_fastq_blablabla.txt'   chr1    132888208   132888208

Answer 1

这可能是您想要的：

readFiles

合并多个文件，并在第一列中添加文件名

1 个答案: