将顶点属性数据从igraph移动到矩阵

时间:2019-11-01 16:07:00

标签: r dataframe igraph data-transform

我在igraph中计算了一些网络数据的集中度统计,我需要两件事(我认为)。

首先,我想将顶点名称(V(g)$name)和我计算出的新的中心度度量((V(g)$eigen)从图形中移到数据框中。

这是图形中$names$eigen的第一行。

$names: year       young        head       black        cent        call      
$eigen: 0.043284327 0.017877101 0.015949110 0.022489540 0.047533029 0.035666735 

我想出了下面的代码,但它只是提取顶点名称,不包括我计算出的(V(g)$eigen统计信息。

第二,一旦在数据框中同时包含两列,我希望该数据框按(V(g)$eigen统计信息进行排序,并且最大值显示在顶部。

    #assigning eigenvector value to vertices
      V(subnet)$eigen = eigen_centrality(subnet, weights = E(subnet)$weight)

    #export two-column vector (vertex name, centrality)  
      subnet_matrix <- as.matrix(c(V(subnet)$name), V(subnet)$eigen)

    #create new data frame with just those two columns  
      subnet_df = as.data.frame(subnet_matrix)

    #sort df by the centrality value (biggest at top)
      sort.list(subnet_df$eigen)

我希望它最终看起来像这样(在数据框中):

NAME     EIGEN
cent     0.047533029
year     0.043284327
call     0.035666735
black    0.022489540
young    0.017877101
head     0.015949110

任何帮助将不胜感激。我是R和编码方面的新手,所以我被这种方法困扰的时间太长了。

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