按顶点核心设置顶点颜色属性

时间:2018-02-02 12:39:21

标签: r igraph

我试图制作一个类似于此的分解核心图: core shells

我可以将coreness传递给igraph图中的vertex.color参数,它会自动分配颜色,但我宁愿用DiagrammeR绘图。它可以使用igraph对象,我只需要首先分配所需的所有属性,在这种情况下,每个顶点的核心和相应的颜色。我的问题是,如何根据核心性质为顶点指定颜色属性?

编辑:我已经为核心shell创建了一个调色板,我对于如何将它们作为一个属性进行分配感到有些迷失,尽管它看起来应该是直的 - 前进。

示例代码:

library(viridis)
library(igraph)
g <- graph_from_literal(1-2, 1-3, 2-3, 2-4, 2-5, 3-4, 4-5, 1-4, 2-6, 6-7)
V(g)$core <- coreness(g, "all")
col_df <- data.frame(node = V(g)$name, core = V(g)$core)
fillcol <- data.frame(core = 1:3, col = plasma(3))
col_df <- merge(col_df, fillcol)

  core node       col
1    1    6 #0D0887FF
2    1    7 #0D0887FF
3    2    5 #CC4678FF
4    3    1 #F0F921FF
5    3    2 #F0F921FF
6    3    3 #F0F921FF
7    3    4 #F0F921FF

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