ExpressionSet（ESet）删除带NA的条目

Question

我试图从ESet中排除我的所有样本，其中10个表型之一没有条目：

我有一个包含50个样本和10个表型的ESet。样品A在表型1中具有NA，在表型3中具有Sampe B.因此我想在我的ESet中删除A和B.

  

我尝试：   申请（ESest @ pData所@数据，如图1所示，功能（I）{如果（is.na（ⅰ））{???}}

抱歉但我不知道;（

Answer 1

如上所述，请使用正确的getter和setter方法来获取所需的数据。在这种情况下，它将是：

ESet[rowSums(is.na(pData(ESet)))==0,]

pData()为您提供带有phenodata的数据框，并根据条件检查pData数据框中的任何行是否包含NA。