分割MRI数据

时间:2019-10-17 02:19:35

标签: python python-3.x

我对MRI数据(.dicom格式)的分割过程有疑问。 我的目标研究是使用SVM方法和python软件对胶体进行分割。之后,通过手动分割制作标签和颜色并进行地面验证。我已经尝试了很多次来分离对象。但这没用。

  1. 在分割过程中检测对象的最佳格式是什么,必须将所有数据更改为jpg / png?
  2. 您能帮助我使用python软件解决此问题(代码)吗?或一步一步给我

现在,我已经阅读并尝试了阈值,那是我的问题

读取数据

coba = np.array(pydicom.read_file('/Users/hardhianrestu/Desktop/Coba/A1/Z115.dcm').pixel_array/2**4).astype(np.uint8)
plt.axis('off')
plt.imshow(coba,cmap='gray')

阈值

ret, thresh = cv2.threshold(coba,0,255,cv2.THRESH_OTSU)
plt.axis('off')
plt.imshow(thresh, 'gray')

我的数据MRI http://www.mediafire.com/file/q90sr9rvrk91ngy/Data.zip/file

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