有一个包含两列(db和tb)的datafarame:db代表数据库,而tb代表该数据库的tableName。
+--------------------+--------------------+
| database| tableName|
+--------------------+--------------------+
|aaaaaaaaaaaaaaaaa...| tttttttttttttttt|
|bbbbbbbbbbbbbbbbb...| rrrrrrrrrrrrrrrr|
|aaaaaaaaaaaaaaaaa...| ssssssssssssssssss|
我在python中有以下方法:
def _get_tb_db(db, tb):
df = spark.sql("select * from {}.{}".format(db, tb))
return df.dtypes
和这个udf:
test = udf(lambda db, tb: _get_tb_db(db, tb), StringType())
运行此程序:
df = df.withColumn("dtype", test(col("db"), col("tb")))
出现以下错误:
pickle.PicklingError: Could not serialize object: Py4JError: An
error occurred while calling o58.__getnewargs__. Trace:
py4j.Py4JException: Method __getnewargs__([]) does not exist
我发现了一些关于stackoverflow的讨论:Spark __getnewargs__ error 但我不确定如何解决此问题? 错误是因为我正在UDF内创建另一个数据框吗?
类似于链接中的解决方案,我尝试了以下方法:
cols = copy.deepcopy(df.columns)
df = df.withColumn("dtype", scanning(cols[0], cols[1]))
但仍然出现错误
有解决方案吗?
答案 0 :(得分:1)
该错误表示您不能在UDF中使用 Spark数据帧。但是由于包含数据库和表名称的数据框很可能很小,因此只需执行Python for
循环就足够了,下面是一些可能有助于获取数据的方法:
from pyspark.sql import Row
# assume dfs is the df containing database names and table names
dfs.printSchema()
root
|-- database: string (nullable = true)
|-- tableName: string (nullable = true)
运行sql select * from database.tableName limit 1
以生成df并返回其dtype,然后将其转换为StringType()。
data = []
DRow = Row('database', 'tableName', 'dtypes')
for row in dfs.collect():
try:
dtypes = spark.sql('select * from `{}`.`{}` limit 1'.format(row.database, row.tableName)).dtypes
data.append(DRow(row.database, row.tableName, str(dtypes)))
except Exception, e:
print("ERROR from {}.{}: [{}]".format(row.database, row.tableName, e))
pass
df_dtypes = spark.createDataFrame(data)
# DataFrame[database: string, tableName: string, dtypes: string]
注意:
使用dtypes
而不是str(dtypes)
将得到以下模式,其中_1
和_2
分别是col_name
和col_dtype
:
root
|-- database: string (nullable = true)
|-- tableName: string (nullable = true)
|-- dtypes: array (nullable = true)
| |-- element: struct (containsNull = true)
| | |-- _1: string (nullable = true)
| | |-- _2: string (nullable = true)
使用此方法,每个表将只有一行。对于接下来的两个方法,表的每个col_type将具有其自己的行。
您还可以通过运行spark.sql("describe tableName")
来检索此信息,通过该操作直接获取数据帧,然后使用reduce函数合并所有表的结果。
from functools import reduce
def get_df_dtypes(db, tb):
try:
return spark.sql('desc `{}`.`{}`'.format(db, tb)) \
.selectExpr(
'"{}" as `database`'.format(db)
, '"{}" as `tableName`'.format(tb)
, 'col_name'
, 'data_type')
except Exception, e:
print("ERROR from {}.{}: [{}]".format(db, tb, e))
pass
# an example table:
get_df_dtypes('default', 'tbl_df1').show()
+--------+---------+--------+--------------------+
|database|tableName|col_name| data_type|
+--------+---------+--------+--------------------+
| default| tbl_df1| array_b|array<struct<a:st...|
| default| tbl_df1| array_d| array<string>|
| default| tbl_df1|struct_c|struct<a:double,b...|
+--------+---------+--------+--------------------+
# use reduce function to union all tables into one df
df_dtypes = reduce(lambda d1, d2: d1.union(d2), [ get_df_dtypes(row.database, row.tableName) for row in dfs.collect() ])
使用spark.catalog.listColumns()创建一个collections.Column
对象的列表,检索name
和dataType
并合并数据。生成的数据帧在其自己的列上使用col_name和col_dtype进行了规范化(与使用 Method-2 相同)。
data = []
DRow = Row('database', 'tableName', 'col_name', 'col_dtype')
for row in dfs.select('database', 'tableName').collect():
try:
for col in spark.catalog.listColumns(row.tableName, row.database):
data.append(DRow(row.database, row.tableName, col.name, col.dataType))
except Exception, e:
print("ERROR from {}.{}: [{}]".format(row.database, row.tableName, e))
pass
df_dtypes = spark.createDataFrame(data)
# DataFrame[database: string, tableName: string, col_name: string, col_dtype: string]
A注意::在检索元数据时,不同的Spark发行版/版本可能与describe tbl_name
和其他命令产生不同的结果,请确保在查询中使用正确的列名。