Cutadapt运行时错误-ModuleNotFoundError

时间:2019-10-09 08:41:56

标签: python bioinformatics

我已经安装了cutadapt,但无法使其正常工作。我在调用软件包时遇到了与其他许多软件包相同的持续错误,但是,将它们手动添加到我的路径或使用完整路径名调用可执行文件并没有帮助。我该怎么办?

我通过conda(bioconda)安装了它:

conda install -c bioconda cutadapt

但是当我尝试运行可执行文件时,我不断收到消息,提示找不到所需的模块:

  

bio91157:condabin chribhar $ cutadapt     追溯(最近一次通话):     文件“ /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/bin/cutadapt”,第6行,在     从cutadapt.main导入main     ModuleNotFoundError:没有名为“ cutadapt.main”的模块

当我添加路径"/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/bin/cutadapt" manually (PATH=$PATH:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/bin/)时,什么都没有改变。

我只需要它就可以开始去除底漆。

我在做什么错?欢迎任何输入。最好,克里斯托弗

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