更新：

Question

我正在使用pyenv来管理python安装和虚拟环境-我希望anaconda成为此类安装之一，并希望能够使用anaconda python创建虚拟环境。使用pyenv install anaconda3-2019.03成功安装，我可以使用pyenv global anaconda3-2019.03激活版本：

SamLee-PC:~ max$ pyenv versions
  system
  2.7.10
  2.7.10/envs/flask_tutorial
* 3.7.4 (set by /Users/max/.pyenv/version)
  3.7.4/envs/learning_python
  3.7.4/envs/microblog
  3.7.4/envs/stocktool
  3.7.4/envs/test1
  anaconda3-2019.03
  anaconda3-2019.03/envs/datsci
  datsci
  flask_tutorial
  learning_python
  microblog
  stocktool
  test1
SamLee-PC:~ max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/3.7.4/bin/python
SamLee-PC:~ max$ pyenv global anaconda3-2019.03
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:~ max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/bin/python
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:~ max$ pyenv which conda
/Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/bin/conda

（我不知道为什么只有通过anaconda安装才将python版本添加到命令提示符）

当我创建一个新的虚拟环境（pyenv virtualenv anaconda3-2019.03 datsci）时，它似乎可以正常工作：

SamLee-PC:~ max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/3.7.4/bin/python
SamLee-PC:~ max$ cd code/linkedin/datsci
(datsci) SamLee-PC:datsci max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/datsci/bin/python
(datsci) SamLee-PC:datsci max$

这与pyenv which python在我的其他虚拟环境中返回的相对位置相同，都可以正常工作。

问题是在虚拟环境中运行的python版本无法访问所有anaconda的软件包：

(datsci) SamLee-PC:datsci max$ anaconda-navigator
pyenv: anaconda-navigator: command not found

The `anaconda-navigator' command exists in these Python versions:
  anaconda3-2019.03

(datsci) SamLee-PC:datsci max$

尽管如果我手动激活python安装，它也会这样做：

SamLee-PC:~ max$ pyenv global anaconda3-2019.03
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:~ max$ anaconda-navigator
WARNING: The conda.compat module is deprecated and will be removed in a future release.
/Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/lib/python3.7/site-packages/anaconda_navigator/api/conda_api.py:1364: YAMLLoadWarning: calling yaml.load() without Loader=... is deprecated, as the default Loader is unsafe. Please read https://msg.pyyaml.org/load for full details.
  data = yaml.load(f)
2019-09-21 14:03:38,666 - ERROR download_api._download:234
Invalid url https://www.anaconda.com/wp-content/uploads/2017/05/Webinar20-20Three20Ways20to20Move20your20Data20Science20Projects20to20Production.png
#anaconda navigator GUI opens

（奇怪的是，datsci指向的python版本似乎可以识别conda：

(datsci) SamLee-PC:datsci max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/datsci/bin/python
(datsci) SamLee-PC:datsci max$ conda
usage: conda [-h] [-V] command ...

conda is a tool for managing and deploying applications, environments and packages.

...

问题是，据我所知，每当我想要anaconda时都以这种方式激活python版本意味着我只能访问anaconda python的一个版本，从而无法在虚拟环境中使用它。

另一个难题-我注意到，对于其他虚拟环境，~/.pyenv/versions/name-of-virtualenv包含文件pyvenv.cfg，其中包含例如以下：

  1 home = /Users/max/.pyenv/versions/3.7.4/bin                                                                   
  2 include-system-site-packages = false
  3 version = 3.7.4

~/.pyenv/versions/datsci中没有这样的文件，所以我添加了一个：

  1 home = /Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/bin                                                       
  2 include-system-site-packages = false
  3 version = anaconda3-2019.03

无济于事。

该目录的内容为：

(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:datsci max$ pwd
/Users/max/.pyenv/versions/datsci
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:datsci max$ ls
bin     conda-meta  include     lib     pyvenv.cfg  share       ssl
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:datsci max$

我想知道我的pyvenv.cfg文件中datsci的内容是否错误...但是我很茫然。

我真的很喜欢pyenv的工作方式，并且我想继续使用它。有没有一种方法可以将anaconda配置为在pyenv下正常运行？

更新：

我卸载了由pyenv管理的anaconda，并按照Simba的建议进行了全新安装。现在默认情况下，pyenv确定活动的python安装，我可以使用conda activate base激活conda了：

Maxs-MacBook-Air:~ max$ which python
/Users/max/.pyenv/shims/python
Maxs-MacBook-Air:~ max$ conda activate base
(base) Maxs-MacBook-Air:~ max$ which python
/Users/max/anaconda3/bin/python
(base) Maxs-MacBook-Air:~ max$

但是，在使用conda create --name datsci创建新的conda环境之后，新的conda环境似乎无法正常激活：

Maxs-MacBook-Air:~ max$ conda activate datsci
(datsci) Maxs-MacBook-Air:~ max$ which python
/Users/max/.pyenv/shims/python

我想念什么？

这是我的.bash_profile的内容：

  1 export PATH="/Users/max/.pyenv/bin:$PATH"                                                                                                                                                                                                 
  2 eval "$(pyenv init -)"
  3 eval "$(pyenv virtualenv-init -)"
  4 
  5 # >>> conda initialize >>>
  6 # !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
  7 __conda_setup="$('/Users/max/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
  8 if [ $? -eq 0 ]; then
  9     eval "$__conda_setup"
 10 else
 11     if [ -f "/Users/max/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
 12         . "/Users/max/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
 13     else
 14         export PATH="/Users/max/anaconda3/bin:$PATH"
 15     fi
 16 fi
 17 unset __conda_setup
 18 # <<< conda initialize <<<

重要的是，我要复制在Simba的.bash_profile?中找到的if语句

更新2：

问题解决了，我不得不在新环境中安装python。

Answer 1

个人建议：请勿使用pyenv安装Anaconda或Miniconda。

pyenv和conda都可以管理不同的python环境。 anaconda安装的pyenv应该仅用作Python解释器。由pyenv从anaconda创建的Python环境仍由pyenv virtualenv处理，而不由conda env create处理。

我一直一起使用这两个工具。事实证明，最好的解决方案是分别安装conda，pyenv，并分别管理其虚拟环境。

始终初始化pyenv
仅公开命令conda，但不激活任何环境

详细信息

安装pyenv。

请正常安装Anaconda或Miniconda，而不要通过pyenv install。

确保pyenv和conda命令在交互式外壳中可用。

通过将以下内容放入外壳初始化文件（对于Bash是pyenv，对于ZSH是.bashrc）来初始化.zshrc。

# Put the content into ~/.bashrc or ~/.bash_profile for Bash,
# .zshrc for ZSH

# you may need to add dir of command `pyenv` into PATH,
# if command pyenv is not available yet

if command -v pyenv &>/dev/null; then
    eval "$(pyenv init -)"
fi
if command -v pyenv-virtualenv &>/dev/null; then
    eval "$(pyenv virtualenv-init -)"
fi

暴露命令conda，但不要激活任何环境，即使是base环境也是如此。在您的Shell中执行以下命令。

# Run the content in the shell

# init conda, the following command write scripts into your shell init file automatically
conda init

# disable init of env "base"
conda config --set auto_activate_base false

注意：完成此设置后，默认的python是pyenv global设置的python。使用pyenv和conda分别管理环境。

管理虚拟环境的示例。

# virtual environments from pyenv
pyenv install 3.6.9
pyenv virtualenv 3.6.9 new-env
pyenv activate new-env
pyenv deactive
# You can also use `pyenv local`


# virtual environments from conda
conda env create new-env python=3.6
conda env list
conda activate new-env
conda deactivate

pyenv的默认环境位置为~/.pyenv/versions。

conda的默认环境位置，请检查conda info的输出。

使用pyenv安装anaconda，无法配置虚拟环境

更新：

更新2：

1 个答案:

详细信息

参考文献