使用Pheatmap剪切错误;休息不是唯一的

时间:2019-09-19 20:56:22

标签: r pheatmap

我正在使用lapply遍历我的矩阵文件,并使用pheatmap函数制作热图。我遇到一个矩阵文件,其中所有绘图列的bin中的值均为0。示例在这里:

a   0   0   0   0   0   0
b   0   0   0   0   0   0
c   0   0   0   0   0   0
d   0   0   0   0   0   0
e   0   0   0   0   0   0
f   0   0   0   0   0   0

如果这是我的矩阵文件之一,那么我正在遍历此错误:

Error in cut.default(x, breaks = breaks, include.lowest = T) : 
  'breaks' are not unique

这是代码:

pheatmap(dmat,
    scale="none",
    cluster_rows = FALSE,
    cluster_cols = FALSE,
    annotation_names_col = FALSE,
    show_colnames= FALSE,
    color = colorRampPalette(rev(brewer.pal(n = 7, name ="RdYlBu")))(500),
    border_color = NA,
    fontsize_row=14
    )

我该如何覆盖?

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