我正在使用lapply遍历我的矩阵文件,并使用pheatmap函数制作热图。我遇到一个矩阵文件,其中所有绘图列的bin中的值均为0。示例在这里:
a 0 0 0 0 0 0
b 0 0 0 0 0 0
c 0 0 0 0 0 0
d 0 0 0 0 0 0
e 0 0 0 0 0 0
f 0 0 0 0 0 0
如果这是我的矩阵文件之一,那么我正在遍历此错误:
Error in cut.default(x, breaks = breaks, include.lowest = T) :
'breaks' are not unique
这是代码:
pheatmap(dmat,
scale="none",
cluster_rows = FALSE,
cluster_cols = FALSE,
annotation_names_col = FALSE,
show_colnames= FALSE,
color = colorRampPalette(rev(brewer.pal(n = 7, name ="RdYlBu")))(500),
border_color = NA,
fontsize_row=14
)
我该如何覆盖?