check.length（“ fill”）错误：'gpar'元素'fill'的长度不能为0

Question

我遇到了一个非常奇怪的错误，可能是for i in d.viewkeys(): ...或R 3.5.1中的错误

以下代码可以正常工作：

pheatmap

但是以下方法不起作用：

rownames(df) <- colnames(mat)
xx <- pheatmap(mat, annotation_col=df)

一切看起来都很完美，但是却出现了错误：

  

check.length（“ fill”）中的错误：     “ gpar”元素“ fill”的长度不能为0

我重新加载了rownames(df) <- str_sub(colnames(mat), 1, -3) xx <- pheatmap(mat, annotation_col=df) ，但问题仍然存在。对Rstudio的{​​{1}}进行的任何修改都无法绘制图表。我也尝试了rownames函数。 有人知道为什么会这样吗？

Answer 1

问题在于colnames(mat)应该与rownames(df)匹配，所以我不能只修改一个而没有另一个。以下代码有效：

colnames(mat) <- str_sub(colnames(mat), 1, -3)
rownames(df) <- colnames(mat)
xx <- pheatmap(mat, annotation_col=df)