我正在学习stan,并且尝试了如下所示的非常简单的模型(bernoulli),我希望后验采样的平均值为0.3,因为先验只是均匀分布,但stan实际上给出了平均值为0.33。这是怎么回事?
顺便说一句,我尝试了“优化”,得到了0.3,这正是我的预期。
感谢您的帮助!
model_code = "
data {
int N;
int y[N];
}
parameters {
real theta;
}
model {
theta ~ uniform(0, 1);
y ~ bernoulli(theta);
}
"
data <- list(
N = 10,
y = c(0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0)
)
fit = stan(model_code=model_code, data=data, iter=5000)
print(fit)
model = stan_model(model_code=model_code)
mle = optimizing(model, data=data)
print(mle, digits=3)
> print(fit)
...
mean se_mean sd 2.5% 25% 50% 75% 97.5% n_eff Rhat
theta 0.33 0.00 0.13 0.11 0.24 0.32 0.42 0.61 6920 1
lp__ -6.56 0.01 0.63 -8.32 -6.71 -6.31 -6.15 -6.11 6813 1
> print(mle, digits=3)
$par
theta
0.3
...
答案 0 :(得分:1)
一个问题是参数缺少上下限,应该像这样声明
real<lower = 0, upper = 1> theta;
但是只有十个观测值,后验平均数不会接近生成它们的参数。
答案 1 :(得分:0)
这是我在Stan入门课程中使用的示例,以确切解释Stan 确实与理论相符的原因。简短的答案是beta分布偏斜,因此均值与模式不匹配。
使用统一的先验,与Light
相同。以观察到的3次成功和7次失败为例,分析后验为Light
。模式(最佳)为3/10,平均值为4/12。优化可以为您提供正确的后验模式估计值0.30,采样可以为您提供正确的后验平均估计值0.33。
随着成功(a)和失败(b)观察次数的增加(即a,b->无穷大),后验模式a /(a + b)和均值(a +1)/(a + b + 2)接近相同的极限,即经验比a /(a + b)。在达到该限制之前,采用均值可以提供比采用众数低的估计均方误差。