ymax和ymin值(在误差栏中)未出现在geompoint中

时间:2019-08-27 16:13:48

标签: r ggplot2 errorbar

我正在尝试绘制一个图表,其中包含4个变量(数量,勘探,大小,来源)的平均值,最大值和最小值,但是没有出现涉及ymax和ymin的线(误差线)。 重复这4个变量是因为它出现在海洋和淡水数据中。

我还想通过在y轴的est列中的变量名称和x轴的均值中放置变量名称来反转图形轴。

有人知道我的脚本错误吗?

Dataset<-read.csv(file= "ICglm.csv", header= TRUE, sep= ";" )
library(ggplot2)
p <- ggplot(Dataset,aes(x=est,ymin=min, ymax=max, y=mean, shape=est))
#Added horizontal line at y=0, error bars to points and points with size two
p <- p + geom_errorbar(aes(ymin=min, ymax=max), width=0, color="black") + 
  geom_point(aes(size=1)) 
#Removed legends and with scale_shape_manual point shapes set to 1 and 16
p <- p + guides(size=FALSE,shape=FALSE) + scale_shape_manual(values=c(20, 20, 20, 20))

#Changed appearance of plot (black and white theme) and x and y axis labels
p <- p + theme_classic() + xlab("Levels") + ylab("confident interval")



#To put levels on y axis you just need to use coord_flip()
p <- p+ coord_flip
est         	min         	max           	mean    	origen
amount	    -0.108911212	-0.100556517	-0.104733865	freshwater
exploration	0.191367902 	0.20873976  	0.200053831	   freshwater
size	    0.003166273 	0.003276336	    0.003221305	   freshwater
source	    -0.241657983	-0.225174165	-0.233416074   freshwater
amount    	0.07	        0.08	         0.075      	marine
exploration	0.33	        0.34          	 0.335	        marine
size	    0.01	        0.01	         0.01	        marine
source    -1.95         	-1.9        	-1.925	        marine

enter image description here

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

在您的代码中,width=0中有geom_errorbar,这就是为什么您看不到错误栏的原因。另外,您应该写coord_flip()。经过这些修改,您的代码应该可以运行:

ggplot(Dataset,aes(x=est,ymin=min, ymax=max, y=mean, shape=est)) +
  geom_errorbar(aes(ymin=min, ymax=max), color="black") + 
  geom_point(aes(size=1)) +
  guides(size=FALSE,shape=FALSE) + scale_shape_manual(values=c(20, 20, 20, 20)) +
  theme_classic() + xlab("Levels") + ylab("confident interval") +
  coord_flip()

但是,您可以使用其旋转版本geom_errorbar代替geom_errorbarh。因此,无需反转轴,est变量可以直接表示为y轴。

ggplot(aes(mean, est, label = origen), data=Dataset) +
  geom_point() +
  ggrepel::geom_text_repel() +
  geom_errorbarh(aes(xmin=min, xmax=max)) + 
  theme_classic() + 
  xlab("confident interval") +
  ylab("Levels")

enter image description here