我正在尝试绘制一个图表,其中包含4个变量(数量,勘探,大小,来源)的平均值,最大值和最小值,但是没有出现涉及ymax和ymin的线(误差线)。 重复这4个变量是因为它出现在海洋和淡水数据中。
我还想通过在y轴的est列中的变量名称和x轴的均值中放置变量名称来反转图形轴。
有人知道我的脚本错误吗?
Dataset<-read.csv(file= "ICglm.csv", header= TRUE, sep= ";" )
library(ggplot2)
p <- ggplot(Dataset,aes(x=est,ymin=min, ymax=max, y=mean, shape=est))
#Added horizontal line at y=0, error bars to points and points with size two
p <- p + geom_errorbar(aes(ymin=min, ymax=max), width=0, color="black") +
geom_point(aes(size=1))
#Removed legends and with scale_shape_manual point shapes set to 1 and 16
p <- p + guides(size=FALSE,shape=FALSE) + scale_shape_manual(values=c(20, 20, 20, 20))
#Changed appearance of plot (black and white theme) and x and y axis labels
p <- p + theme_classic() + xlab("Levels") + ylab("confident interval")
#To put levels on y axis you just need to use coord_flip()
p <- p+ coord_flip
est min max mean origen
amount -0.108911212 -0.100556517 -0.104733865 freshwater
exploration 0.191367902 0.20873976 0.200053831 freshwater
size 0.003166273 0.003276336 0.003221305 freshwater
source -0.241657983 -0.225174165 -0.233416074 freshwater
amount 0.07 0.08 0.075 marine
exploration 0.33 0.34 0.335 marine
size 0.01 0.01 0.01 marine
source -1.95 -1.9 -1.925 marine
答案 0 :(得分:1)
在您的代码中,width=0
中有geom_errorbar
,这就是为什么您看不到错误栏的原因。另外,您应该写coord_flip()
。经过这些修改,您的代码应该可以运行:
ggplot(Dataset,aes(x=est,ymin=min, ymax=max, y=mean, shape=est)) +
geom_errorbar(aes(ymin=min, ymax=max), color="black") +
geom_point(aes(size=1)) +
guides(size=FALSE,shape=FALSE) + scale_shape_manual(values=c(20, 20, 20, 20)) +
theme_classic() + xlab("Levels") + ylab("confident interval") +
coord_flip()
但是,您可以使用其旋转版本geom_errorbar
代替geom_errorbarh
。因此,无需反转轴,est
变量可以直接表示为y轴。
ggplot(aes(mean, est, label = origen), data=Dataset) +
geom_point() +
ggrepel::geom_text_repel() +
geom_errorbarh(aes(xmin=min, xmax=max)) +
theme_classic() +
xlab("confident interval") +
ylab("Levels")