Question

我想将每个文件夹（具有唯一名称）中以fastq.gz结尾的特定文件批量复制到新目录，但是它一直给我一个错误，指出找不到该文件。是因为我使用通配符错误？

for f in ./*/split-adapter-quality-trimmed/*.fastq.gz; do
    cp *fastq.gz ../../new;
done

Answer 1

执行for f in ./*/split-adapter-quality-trimmed/*.fastq.gz将已经在变量*.fastq.gz中包含以f结尾的文件名。因此，可以在循环内的cp（cp $f destination）中直接使用它。如果将echo $f放入循环中，则可以查看所有文件并在cp之前进行验证。

for f in ./*/split-adapter-quality-trimmed/*.fastq.gz; do
    cp $f ../../new;
done

Answer 2

除非您绝对要使用for-loop，否则可以使用一个find命令执行该操作：

find ./*/split-adapter-quality-trimmed -name "*fastq.gz" -exec cp {} ../../new \;

它将浏览与./*/split-adapter-quality-trimmed匹配的目录，查找以fastq.gz结尾的每个文件，然后执行所需的cp命令（在shell的当前目录中，命令行以半角结尾-冒号）：

cp <found-path> ../../new

（通配符*fastq.gz用引号引起来，以防止Bash解释它，以防万一。分号也是如此。）

将文件从子目录批量复制到新文件夹？

2 个答案: