Question

我正在尝试首次使用Docker和ShinyProxy，并且在该过程的开始就一直在努力工作。

我开发了一些在本地运行良好的闪亮应用程序，我正在考虑在我网站的某些文章中部署它们。

那些闪亮的应用程序使用我自己编写的2个程序包，这些程序包位于计算机的本地位置。

如何在我的Dockerfile中安装这些私有R包，以便“容器”可以访问它们？

我看到了无数示例，这些示例从CRAN安装软件包，我对此没有任何问题。但是，我找不到从本地存储库安装自己的软件包的方法。

目前，我有一个名为“ DockerEC”的文件夹，其中包含以下文件：

'App.R'
'run_app.R'
'installpackages.R'
'Dockerfile'

在我的本地闪亮应用程序中，我只需使用以下命令即可安装这些软件包：

install.packages("/Users/name/Documents/R/Package_NAME", repos = NULL, type="source")

我在installpackages.R文件中写了这一行代码，但是由于出现错误：“无此文件或目录”而无法运行该文件。

我用过

COPY /Users/name/Documents/R/DockerEC/installpackages.R /Users/name/Documents/R/DockerEC/installpackages.R

然后

RUN Rscript /Users/name/Documents/R/DockerEC/installpackages.R

在我的docker文件中，但不知道为什么我找不到该文件？

有人有在dockerfile中安装私有R包的具体示例吗？我想念一个具体的例子来了解如何做...

Answer 1

尝试下面的Dockerfile，它对我有用：

FROM rocker/r-ver:3.6.1

RUN mkdir ./private_pkgs

COPY /Users/name/Documents/R/your_package.tar.gz ./private_pkgs/your_package.tar.gz

RUN R -e "install.packages('private_pkgs/your_package.tar.gz', repos = NULL, type = 'source')"

在docker文件中安装私有R包

1 个答案: