在docker文件

Question

在我的docker文件中，我想安装med2image python包（https://github.com/FNNDSC/med2image）。我使用以下代码：

FROM ubuntu:16.04
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
    python3.5 \
    python3-pip \
    && \
apt-get clean && \
rm -rf /var/lib/apt/lists/*
RUN pip install nibabel pydicom matplotlib pillow
RUN pip install med2image

但是当我想要构建图像时出现以下错误：

Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/6f/e5/948b023c7feb72adf7dfb26d90a13c838737bbf52be704f5ddd0878e3264/med2image-1.1.2.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
Sorry, only Python 3.5+ is supported.

----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in  /tmp/pip-install-FnNb_S/med2image/
The command '/bin/sh -c pip install med2image' returned a non-zero code: 1

我该怎么办？！

Answer 1

其他一些答案/评论建议更改您的基本影像，但如果您想保留您的ubuntu 16.04，您也可以简单地指定您的pip / python版本以使用pip3或pip3.5那样：

FROM ubuntu:16.04
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
    python3.5 \
    python3-pip \
    && \
apt-get clean && \
rm -rf /var/lib/apt/lists/*
RUN pip3 install nibabel pydicom matplotlib pillow
RUN pip3 install med2image

Answer 2

正如我的评论中所建议的那样，您可以编写一个类似于：

的Dockerfile

FROM python:3

RUN pip install --upgrade pip && \
    pip install --no-cache-dir nibabel pydicom matplotlib pillow && \
    pip install --no-cache-dir med2image

CMD ["cat", "/etc/os-release"]

上面的命令示例可以在运行时确认（docker build -t test . && docker run --rm -it test）此图像基于Debian GNU / Linux 8（jessie）。

Answer 3

尝试pip3

RUN pip3 install nibabel pydicom matplotlib pillow
RUN pip3 install med2image

Answer 4

如果您的 docker 容器中有 Jupyter Notebook，则可以通过单击此处显示的按钮在 Jupyter 中运行新的 终端 来安装任何 python 包：

并运行：wd

即使您退出容器，该包仍会保留在 docker 容器中。