我试图仅用ROI在细胞图像中做遮罩,因此我用OpenCV在ROI周围应用了轮廓,但是我一直在努力使轮廓位于轮廓内。我想将此区域放在白色内,然后将轮廓移开,其余部分放在外面。
cell = cv.imread(original, 0) # original cell image after matching template
imgray = cv.cvtColor(cell,cv.COLOR_BGR2GRAY)
ret,thresh_binary = cv.threshold(imgray,127,255,cv.THRESH_BINARY)
生成的图像为:
原来是:
从匹配模板和已经标记的单元轮廓之后的另一幅图像中,该图像在代码中读取:
因此,基本上我需要在封闭的轮廓区域中使用白色,然后丢弃所有其余部分(即黑色)。 有人可以给我一些帮助或暗示我该怎么做吗?
答案 0 :(得分:2)
这是一种方法:
我们找到轮廓,然后使用-1
作为厚度参数用cv2.drawContours()
填充轮廓
要删除行部分,我们可以使用morphological transformations
import cv2
image = cv2.imread('1.png')
gray = cv2.cvtColor(image, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
cnts = cv2.findContours(gray, cv2.RETR_EXTERNAL, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
cnts = cnts[0] if len(cnts) == 2 else cnts[1]
for c in cnts:
cv2.drawContours(gray,[c], 0, (255,255,255), -1)
kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (20,20))
opening = cv2.morphologyEx(gray, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=2)
cv2.imshow('gray', gray)
cv2.imshow('opening', opening)
cv2.imwrite('opening.png', opening)
cv2.waitKey(0)