根据颜色值将多维Numpy数组转换为二维数组

时间:2019-07-27 20:59:03

标签: python arrays image numpy indexing

我有一个图像,该图像被读取为形状为(512,512,3)的uint8数组。 现在,我想将此数组转换为形状为(512,512,1)的uint8数组,其中第三轴上的每个像素值都从颜色值[255,0,0]转换为单个类标签值[3] ,基于以下颜色/类编码:

1 : [0, 0, 0], 
 2 : [0, 0, 255], 
 3 : [255, 0, 0], 
 4 : [150, 30, 150], 
 5 : [255, 65, 255], 
 6 : [150, 80, 0], 
 7 : [170, 120, 65], 
 8 : [125, 125, 125], 
 9 : [255, 255, 0], 
 10 : [0, 255, 255], 
 11 : [255, 150, 0], 
 12 : [255, 225, 120], 
 13 : [255, 125, 125], 
 14 : [200, 100, 100], 
 15 : [0, 255, 0], 
 16 : [0, 150, 80], 
 17 : [215, 175, 125], 
 18 : [220, 180, 210], 
 19 : [125, 125, 255]

最有效的方法是什么?我想遍历所有类并使用numpy.where,但这显然很耗时。

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您可以使用巨型查询表。让cls为[[0,0,0], [0,0,255], ...]中的dtype=np.uint8

LUT = np.zeros(size=(256,256,256), dtype='u1')
LUT[cls[:,0],cls[:,1],cls[:,2]] = np.arange(cls.shape[1])+1
img_as_cls = LUT[img[...,0],img[...,1], img[...,2]]

此解决方案是每个像素O(1)。这也是非常有效的缓存,因为实际上使用了LUT中的一小部分条目。在我的计算机上处​​理1000x1000图像大约需要10毫秒。

通过将3色通道转换为24位整数可以稍微改善该解决方案。 这是代码

def scalarize(x):
    # compute x[...,2]*65536+x[...,1]*256+x[...,0] in efficient way
    y = x[...,2].astype('u4')
    y <<= 8
    y +=x[...,1]
    y <<= 8
    y += x[...,0]
    return y
LUT = np.zeros(2**24, dtype='u1')
LUT[scalarize(cls)] = 1 + np.arange(cls.shape[0])
simg = scalarize(img)
img_to_cls = LUT[simg]

优化后,大约需要5毫秒来处理1000x1000的图像。

答案 1 :(得分:2)

这是基于views-

# https://stackoverflow.com/a/45313353/ @Divakar
def view1D(a, b): # a, b are arrays
    # This function gets 1D view into 2D input arrays
    a = np.ascontiguousarray(a)
    b = np.ascontiguousarray(b)
    void_dt = np.dtype((np.void, a.dtype.itemsize * a.shape[-1]))
    return a.view(void_dt).ravel(),  b.view(void_dt).ravel()

def img2label(a, maps):
    # Get one-dimension reduced view into input image and map arrays.
    # We need to reshape image to 2D, then feed it to view1D to get 1D
    # outputs and then reshape 1D image to 2D 
    A,B = view1D(a.reshape(-1,a.shape[-1]),maps)
    A = A.reshape(a.shape[:2])

    # Trace back positions of A in B using searchsorted. This gives us
    # original order, which is the final output.
    sidx = B.argsort()
    return sidx[np.searchsorted(B,A,sorter=sidx)]

鉴于标签从1开始,您可能想在输出中添加1

样品运行-

In [100]: # Mapping array
     ...: maps = np.array([[0, 0, 0],[0, 0, 255],\
     ...:                  [255, 0, 0],[150, 30, 150]],dtype=np.uint8)
     ...: 
     ...: # Setup random image array
     ...: idx = np.array([[0,2,1,3],[1,3,2,0]])
     ...: img = maps[idx]

In [101]: img2label(img, maps) # should retrieve back idx
Out[101]: 
array([[0, 2, 1, 3],
       [1, 3, 2, 0]])

答案 2 :(得分:2)

一种方法:使用True值分别创建布尔数组,其中输入的像素值与调色板值之一匹配,然后使用算术对其进行组合。因此:

palette = [
    [0, 0, 0], 
    [0, 0, 255], 
    [255, 0, 0],
    # etc.
]

def palettized(data, palette):
    # Initialize result array
    shape = list(data.shape)
    shape[-1] = 1
    result = np.zeros(shape)
    # Loop and add each palette index component.
    for value, colour in enumerate(palette, 1):
        result += (data == colour).all(axis=2) * value
    return result