Question

我尝试进行t.test，并与参照组（d）进行比较。我的数据如下：

Letter  method  Wiederfindung.ng
a   Quantus           4
a   Quantus           4
a   Quantus           4
b   Quantus           6
b   Quantus           5
b   Quantus           5
c   Quantus           18
c   Quantus           39
c   Quantus           12
d   theoretical       28,12

compare_means(Wiederfindung.ng ~ Letter,  data = Sa_Quantus_low, ref.group = "d", method = "t.test")

我收到协音

t.test.default（xi，xj，成对=成对，备选= 另一种选择：没有足够的“ y”观测值

将方法从t.test更改为wilcox.test时，没有错误消息。

compare_means(Wiederfindung.ng ~ Letter,  data = Sa_Quantus_low, ref.group = "d", method = "wilcox.test")

我想知道字母a，b，c与d之间是否有区别。

Answer 1

compare_means中的

ggpubr是一个永远不应该使用的函数，至少不能与t检验一起使用，因为它会在组之间进行多个比较，而不会在适当的位置执行适当的ANOVA -hoc测试。而且您的数据甚至看起来都不适合参数化方法（这些计数吗？）。

无论如何，compare_means调用t.test进行单个比较。当组只有一个观察值时（例如数据的最后一行），此操作将失败。另外，即使您删除了组d并指定了另一个参考组，它仍然会失败，因为您的数据不是数字的。但是，因为t.test就是这样，错误消息将无济于事：它不会告诉您已给它提供了一个字符向量，而是显示

if（stderr <10 * .Machine $ double.eps * max（abs（mx）， abs（my）））stop（“数据本质上是恒定的”）：缺少值需要TRUE / FALSE的地方

查找错误以在R中使用ggsignif执行t.test？

1 个答案: