使用ggplotly转换Alpha美学

时间:2019-07-14 12:23:51

标签: r ggplot2 heatmap r-plotly ggplotly

我一直在研究ggplot2中使用的热图,现在我试图将它们转换为ggplotly,以使用它们构建一个shiny应用。除了geom_tile中的alpha美学翻译(如果我use geom_raster出现同样的问题)之外,其他所有内容都可以(或多或少)正常运行。经过一整天的搜寻和阅读相关答案之后,我还没有找到任何解决方案。

我尝试使用不同的数据和规格,到目前为止完全没有运气。这个问题似乎特定于热图,因为如果我使用geom_point,alpha转换效果很好。问题是,我确实需要进行工作的热图。

我提供了一个可复制的示例来说明问题。

library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)

sample<- data.frame(a = 1:10,
                b = 11:20,
                c = 31:40,
                d = rep(c("a", "b"), 5))


plot <- sample%>%
  ggplot(aes(x=a, y=b, fill = c, alpha = d))+
  geom_raster()

plot

ggplotly(plot)

您将看到输出完全不同。有什么想法或有类似的问题吗?

ggplot:

ggplot

ggplotly:

ggplotly

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我同意plotly::ggplotly()的翻译不正确。我尝试了ggplot2::geom_rect()ggplot2::geom_tile()以及ggplot2::scale_color_manual()ggplot2::scale_color_identity()的一些变体。

这是一个热图示例,不带ggplot2层而直接编写为plotly。我没有看到直接映射Alpha /不透明度的方法。

如果您不需要在绘图中更改Alpha,仅需要几何尺寸正确,这应该可以满足您的需求。

ds <- tibble::tibble(
  x   =  1:10,
  y   = 11:20,
  z   = 31:40,
  a1  = rep(c("a", "b"), 5),
  a2  = rep(c( .1,   .4), 5)
)

plot_ly(ds) %>% 
  add_heatmap(x = ~x, y = ~y, z = ~z, opacity = .5,  colors = "YlGnBu")

plotly-heatmap

如果您需要改变alpha值,我猜当前最好的方法是创建一个自定义调色板,该调色板设置rgb a 的所有四个通道。

答案 1 :(得分:1)

万一有人遇到类似问题,我找到了解决方法(这似乎是ggplotly的一个错误),方法是使用geom_point()创建热图并调整点的形状和大小直到看起来一样。显然,ggplotly确实很好地翻译了该几何图形的alpha aes。

这是最终结果(闪亮的应用程序的目的是能够选择一个具有参考年份的对角线以将其与其他对角线隔离):

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