biomod2不绘制数据

时间:2019-07-11 15:09:35

标签: r bioinformatics

我正在尝试运行基本物种分布模型,而biomod2并未绘制我的存在数据。我可以尝试在此处重新创建问题,但是显然我无法上传正在使用的tif文件。为了对其进行测试,我只创建了一个与哥伦比亚的垂直垂直线相对应的经度纬度值矩阵,如下所示:

tmp <- seq(-1,10,0.01) # latitude
tmp2 <- rep(-75,length(tmp)) # longitude
testVec <- cbind(tmp2,tmp)
myRespXY <- testVec

这些是我的状态数据的坐标。然后,我使用状态数据,所以我有

myResp <- as.numeric(rep(1,nrow(myRespXY)))

然后,使用biomod2的格式化功能

myBiomodData <- BIOMOD_FormatingData(resp.var = myResp, # presence data (all 1's)
                                 expl.var = myExpl, # RasterStack
                                 resp.xy = myRespXY, # coordinates of presences, corresponding to a vertical line in Colombia
                                 resp.name = myRespName) # name of species
plot(myBiomodData)

See the output here.

我在做什么错? biomod2正在读取状态,有时它会绘制一些点,但不会绘制大多数。如何获得输出以绘制所有在场数据?

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