matplotlib / seaborn：将第一行和最后一行切成热图图的一半

Question

当使用seaborn（以及使用matplotlib的相关矩阵）绘制热图时，第一行和最后一行被切成两半。 当我运行这个在网上找到的最小代码示例时，也会发生这种情况。

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

y轴上的标签在正确的位置，但行并不完全在此处。

几天前，它按预期工作。从那时起，我安装了texlive-xetex，因此我再次将其删除，但是并不能解决我的问题。

有什么想法我可能会错过吗？

Answer 1

它是3.1.0和3.1.1之间的matplotlib回归中的错误 您可以通过以下方式纠正此问题：

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

Answer 2

使用上述方法修复并手动设置热图限制。

第一

ax = sns.heatmap(...

用

检查当前轴

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

已修复

ax.set_ylim(6.0, 0)

Answer 3

我通过在代码中用matplotlib==3.1.1添加这一行来解决了这个问题：

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

NB。起作用的唯一原因是因为x轴未更改，因此在将来的mpl版本中使用后果自负

Answer 4

不幸的是， matplotlib 3.1.1 broke seaborn heatmaps ；以及通常带有固定刻度的倒转轴。
在当前的开发版本中已修复此问题。您可能因此

• 还原为matplotlib 3.1.0
• 等待matplotlib 3.1.2
• 手动设置热图限制

Answer 5

matplotlib 3.1.2已发布- 它可以通过conda-forge在Anaconda云中使用，但是我无法通过conda install进行安装。 手动替代方法有效： 从github下载matplotlib 3.1.2并通过pip安装

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

Answer 6

它发生在importanceofbeingernest所建议的matplotlib版本3.1.1中

以下解决了我的问题

pip install matplotlib==3.1.0

Answer 7

rustyDev关于conda-forge是正确的，但是我不需要从github下载进行手动pip安装。对我来说，在Windows上，它可以直接工作。而且情节都很好。

ARMv7-M reference manual

conda install -c conda-forge matplotlib

可选点，答案不需要：

然后，我尝试了其他步骤，但没有必要：在conda提示符下：conda search matplotlib --info未显示新版本信息，最新信息为3.1.1。因此，我尝试使用pip install matplotlib==3.1.2点子，但是点子说“要求已经满足”

然后根据medium.com/@rakshithvasudev/…获取版本。python - import matplotlib - matplotlib.__version__显示3.1.2已成功安装

顺便说一句，将Spyder更新到v4.0.0之后，我直接遇到了此错误。误差在混淆矩阵图中。几个月前已经提到过这一点。 stackoverflow.com/questions/57225685/…已经与这个棘手的问题相关联。

Answer 8

为我工作：

b, t = plt.ylim()
b += 0.5
t -= 0.5
custom_ylim = (b, t)
plt.setp(axes, ylim=custom_ylim)

Answer 9

降级您的matplotlib

!pip install matplotlib==3.1.0

并将此行添加到您的绘图代码中：

ax[i].set_ylim(sorted(ax[i].get_xlim(), reverse=True))
 

Answer 10

conda安装matplotlib = 3.1.0

这对我有用，并将matplotlib从3.1.1降级到3.1.0，并且热图开始正确运行

Answer 11

正如@ImportanceOfBeingErnest 所提到的，这个问题是由于特定版本的 matplotlib 中的 seaborn heatmaps 损坏造成的，所以这个问题的简单解决方案是升级 matplotlib，如下所示：

pip install --upgrade matplotlib

Answer 12

我用以下代码解决了这个问题：