我使用PCAmixdata
包来减小多个分类列的尺寸。但是,我一直收到
“ X.quali中存在所有类别都相同的列”错误。
我不太确定群组和name.groups
设置。
这是数据集中的样本。
Hybrid G1 G5 G8 G9 G10
P1000:P2030 0 -1 0 1 0
P1006:P1384 0 0 0 0 1
P1006:P1401 0 NA NA NA 1
P1006:P1412 0 0 0 0 1
P1006:P1594 0 0 0 0 1
P1013:P1517 0 0 0 0 1
我正在R中进行一个遗传项目。在此数据集中,有497行和11,226列。每行是特定杂种的遗传标记系列,每列是值为1、0,-1和NA的遗传标记(“ G1”,“ G2”等)。我正在尝试使用MFAmix
缩小尺寸,以便继续进行预测。
MFAmix(data = geno,groups=index,name.groups = colnames(geno))
我分别将它们设置为seq(1, ncol(geno))
和colnames(geno)
,其中geno是test_fill
的变量名。我想知道这些设置是否正确。