如何通过重复测量设计和二项式数据分布对多项选择实验进行GLMM分析?

时间:2019-07-04 12:37:06

标签: r glm lme4

我做了一个多项选择实验,在这个实验场中,我有动物(每重复n = 6),它们可以在四种不同类型的庇护所之间进行选择。避难所代表了两个因素A和B的组合(每个因素具有两个等级)。此外,我有两组不同的动物,它们在实验之前接受了不同的处理(因子C,两个水平)。目的是测试因子A或因子B或两者的组合(即因子之间的相互作用)是否影响试验动物的庇护所选择,以及这种偏好模式是否在因子C组之间改变。在每个避难所内的人数,这是在随后的14次观察中确定的,因此,我也进行了重复测量设计。请注意,避难所之间有一个开放空间,当动物位于避难所外面时不算动物。

因此,我尝试拟合GLMM,其中个体(prop = n / 6)的比例与因子A,B和C的函数以及解释重复测量设计的术语(1 |重复):

model <- glmer (prop ~ A * B * C + (1|replicate), family=binomial, weights = total, data = data )

我的问题是输出几乎提供了几乎所有因素和相互作用,并且在我的数据中,其中一些差异还不清楚,因此我不太相信结果。有人可以告诉我我(基本上)是否做对了吗?还是我的模型中有任何市长错误?

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