通过自定义循环将自定义函数应用于R中的数据帧列表

时间:2019-06-27 17:51:50

标签: r list dataframe lapply

我尝试通过3个自定义函数循环显示df元素列表。当我手动运行每个df但应用lapply失败时,它可以工作。 仅供参考:结果应导致“扩展”每个数据集,稍后将用于裁剪图像文件。数据txt文件的扩展名为.swc,但仅仅是txt文件。 当我通过函数手动运行数据集时,它将起作用。然后我 将多个文件导入到列表中也可以。 但是,当我尝试使用lapply通过函数运行每个列表元素时,出现以下错误

这是实际应用lapply

result<-lapply(df_swc_list, fxn(x))

使用dfs并将其导入列表

df_swc1 <- data.frame(V1 = c(1,2,3,4), V2 = c(17.2,17.2,18.2,18.2), 
V3=c(105.32,106.01,108.89,109.99), V4=c(3,4,4,6), V5=c(1,2,2,2), 
V6=c(7,7,7,7), V7=c(-1,0,1,2))
df_swc2 <- data.frame(V1 = c(1,2,3,4), V2 = c(17.2,17.2,18.2,18.2), 
V3=c(105.32,106.01,108.89,109.99), V4=c(5,5,4,5), V5=c(1,2,2,2), 
V6=c(7,7,7,7), V7=c(-1,0,1,2))
df_swc_list <- list(df_swc1,df_swc2)
df_swc_list_names<-c("control", "variable")
names(df_swc_list)<-gsub("\\.swc$", "",df_swc_list_names)

pythag.opp.leg<-function(Radius){
Diam<-Radius*2
opposite<-sqrt((Diam^2)/2)
opposite.rounded<-round(opposite)
box<-opposite.rounded/2
return(box)
}

swc.fxn <-function(df1){
box<- round(pythag.opp.leg(df1$Radius))
swc.box<- Map(function(a, b, c, d, e) data.frame(X = a:b, Y = c:d, Z = e), 
            df1$X-box, df1$X+box, df1$Y-box, df1$Y+box, df1$Z)
swc.box2<- purrr::map_df(swc.box, function(x) tidyr::expand(x, X, Y, Z))
return(swc.box2)
} 

swc_process_A<-function(x){
as.data.frame(x)->swc2
swc2[,2:6]->swc3
swc3$V2->swc3$Type
swc3$V3->swc3$X
swc3$V4->swc3$Y
swc3$V5->swc3$Z
swc3$V6->swc3$Radius
swc3[,6:10]->swc4
trunc(swc4$X)->swc4$X
trunc(swc4$Y)->swc4$Y
trunc(swc4$Z)->swc4$Z
swc4->swc5
as.data.frame((swc.fxn(swc5)))->expanded.swc.df2
return(expanded.swc.df2)
}

尝试应用lapply循环

`result<-lapply(df_swc_list, swc_process_A(x))`

df_swc1(列表中的第一个df元素)的预期结果

str(expanded.swc.df)

data.frame':484磅。 3个变量:

X:整数100100100100100100100100100100 ...

Y:int -2 -1 0 1 2 3 4 5 6 7 ...

Z:num 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...

实际错误消息显示错误信息

[。data.frame`(swc3,,6:10):未定义的列已选中

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

最讨厌的呼叫应该是lapply(df_swc_list, "swc_process_A")