使用组套索时出现“ dim(X)必须为正长度”错误

时间:2019-06-25 18:22:07

标签: r regularized

我正在尝试使用gglasso()包的一部分gglasso命令来拟合组套索模型。以下是有关我的数据的一些初步详细信息:

as.matrix(x)是62 x 500的数据矩阵。

colon$yn是一个62 x 1的响应向量,其值为-1或1(用于分类)。

as.numeric(clus_num$cluster)是500个预测变量所属的组的列表(长度为500)。此数据集中共有15个群集。

我尝试如下设置套索组:

> group = clus_num$cluster
> glasso_mod = gglasso(x = as.matrix(x), y = colon$yn, 
                     group = as.numeric(clus_num$cluster), loss = "logit")

现在,我正在尝试使用plot()命令绘制关于lambda的系数。但是,当我运行此代码时,出现以下错误:

> plot(glasso_mod, group = TRUE, log.l = FALSE)
Error in apply(tmp[ix[g]:iy[g], ], 2, crossprod) : 
  dim(X) must have a positive length

发生这种情况有什么原因吗?

作为参考,我将基于here提供的示例创建我的代码;数据是gglasso库的一部分,因此只要调用该库,此代码就可以工作:

> data("bardet")
> group = rep(1:20,each=5)
> m1 = gglasso(x = bardet$x, y = bardet$y, group = group, loss = "ls")
> plot(m1, group = TRUE, log.l = FALSE)

编辑修复了示例中的错字。

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