Question

我想看看矩阵中有多少正面和负面我只是使用以下命令来获取负值但我得到错误

apply(m[,2], 2, function(x) length(x[x<0]))

我的矩阵看起来如下并命名为m

    row.names   logFC        AveExpr       t         P.Value    adj.P.Val       B
1   AFFX    0.254330303 -0.0273913479   2.790941    0.005346628 0.9936675   -2.351052
2   AFFX-   0.144249680 -0.0081323315   2.744752    0.006154509 0.9936675   -2.470447
3   AFFX-T  0.129062121 -0.0072936248   2.730567    0.006423832 0.9936675   -2.506720
4   AFFy    0.105893838 -0.0084886157   2.672831    0.007632963 0.9936675   -2.652445
5   AFfm    0.146253131 -0.0123657559   2.617852    0.008970330 0.9936675   -2.788357
6   20uy    1.033582071 0.9319210383    2.476302    0.013425076 0.9936675   -3.125444
7   2196    0.099556431 -0.0061285974   2.451229    0.014392052 0.9936675   -3.183222



**Error in apply(m[, 2], 2, function(x) length(x[x < 0])) : 
  dim(X) must have a positive length**

Answer 1

您只需输入：

即可

sum(m<0)

，它给出了整个矩阵的负值数。如果你想要每行或每列，那么

colSums(m<0)

和

rowSums(m<0)

会给你答案

dim（X）必须在R中具有正长度

1 个答案: