Question

我正在使用perpflot库来测试DatetimeIndex对搜索熊猫数据框的影响。

我定义了一个设置函数来创建2个数据帧。一个带有日期时间索引，另一个带有时间作为列。我还定义了2个函数，分别在索引和列中使用.loc并返回子数据。但是，它向我显示了typeError。

TypeError: ufunc 'isfinite' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''

代码：

import numpy as np
import pandas as pd
from datetime import datetime
import perfplot


def setup_code(n):
    timeline = pd.date_range(end=datetime.now(), freq='1s', periods=n)
    sensor_readings = np.random.randint(100, size=(n, 4))
    col_labels = ['Sensor1', 'Sensor2', 'Sensor3', 'Sensor4']
    data = pd.DataFrame(sensor_readings, columns=col_labels)
    data['time'] = timeline
    data['time'] = pd.to_datetime(data['time'])
    data2 = data.copy()
    data2 = data2.set_index('time')
    print(n)
    return [data, data2]


def f1(ldata):
    data = ldata[0]
    subdata = data.loc[(data['time'] >= '2019-06-21 08:00:00') & (data['time'] <= '2019-06-21 11:00:00')]
    return subdata


def f2(ldata):
    data = ldata[1]
    subdata = data.loc['2019-06-21 04:00:00':'2019-06-21 10:00:00']
    return subdata


out = perfplot.bench(
    setup=setup_code,  
    kernels=[
        f1, f2
    ],
    n_range=[1000 ** k for k in range(1, 3)],
    labels=['Without Indexing', 'With Indexing'],
    xlabel='Length of DataFrame'
)
out.show()

跟踪：

Traceback (most recent call last):                                                                                                | 0/2 [00:00<?, ?it/s]
  File ".\scratchpad.py", line 39, in <module>
    xlabel='Length of DataFrame'
  File "C:\Users\hpandya\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\perfplot\main.py", line 128, in bench
    reference, kernel(data)
  File "C:\Users\hpandya\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\numpy\core\numeric.py", line 2423, in allclose
    res = all(isclose(a, b, rtol=rtol, atol=atol, equal_nan=equal_nan))
  File "C:\Users\hpandya\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\numpy\core\numeric.py", line 2521, in isclose
    xfin = isfinite(x)
TypeError: ufunc 'isfinite' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''

很奇怪，在我定义xlabel的那一行显示错误。我觉得好像我在这里错过了一些琐碎的事情。

Answer 1

默认情况下，bench()和show()方法比较内核输出，以确保所有方法产生相同的输出（出于正确性）。该检查是使用numpy函数完成的，可能不适用于所有情况或所有内核输出。

您要执行的操作是指定一个equality_check参数，该参数在比较输出方式方面具有一定的灵活性。当比较诸如numpy无法很好处理的字符串或字典等可迭代对象时，这特别有用。

如果您确信自己的函数正确无误，请将equality_check设置为“无”，否则将传递实现您自己的检查逻辑的可调用对象。

out = perfplot.bench(
    ...
    equality_check=lambda x, y: x.equals(y)  # equality_check=None
)

有关如何使用equality_check计时不同功能的更多示例，请参见this answer（滚动到底部）。

Perfplot bench（）引发“ TypeError：输入类型和输入类型不支持ufunc'isfinite'”

1 个答案: