我有一个很大的bgzipped vcf文件,其中包含700只狗的整个基因组,我需要对其进行索引才能在其上运行bcftools命令。
我已经使用了tabix命令
tabix -p vcf 772g.990.SNP.INDEL.chrAll.vcf.bgz
-p vcf指示用于索引的输入格式,所以我不知道为什么它不起作用。唯一的其他格式选项似乎是gff,bed和sam。 它返回:
segmentation fault (core dump)
我不确定是什么问题,因为文件被bgzzip压缩并且命令应该(我认为可以)。任何帮助都太棒了!