群集切割和合并树状图

时间:2019-06-11 11:21:22

标签: r hierarchical-clustering dendrogram

我正在尝试翻转四群集树状图的最后两个群集。这不会改变我的树状图的含义,但是在视觉上,与以后的分析相比,这更有意义。

我试图将原始的树状图(弯角)剪切并合并为新的树状图(hc)。

这在本质上是可行的,但是hc没有dends的距离和聚类方法属性。

这些是dends的属性:

DeriveAmbiguousTypes

这就是我将窝点切割并合并到hc中的方式:

    > dends

    Call:
    hclust(d = d, method = "ward.D2")

    Cluster method   : ward.D2 
    Distance         : euclidean 
    Number of objects: 111 

但这是hc的属性:

    cluster1 <- dends[[1]]
    cluster2 <- dends[[2]][[1]]
    cluster3 <- dends[[2]][[2]][[2]]
    cluster4 <- dends[[2]][[2]][[1]]
    hc <- as.hclust(merge(merge(merge(cluster4, cluster3), cluster2), cluster1))

我意识到hc正在调用另一个函数进行dends,这可能是导致此问题的原因,但是我不太确定如何合并所有集群。

hc是否可以保留dends的属性,或者可以某种方式将它们分配给hc? 或者,如果失败,是否存在另一种方式来翻转树突的两个末端簇的顺序?

谢谢。

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