有没有一种方法可以通过计算沿时间维度的每个单元格的模式来汇总xarrray DataArray?

时间:2019-05-27 15:40:54

标签: python python-xarray

xarray python程序包中,可以通过沿某个维度(最常见的是沿时间维度)应用函数来减少DataArray的数据。内置函数包括平均值,最小值和最大值。即:

DataArray.mean(dim = 'time')
DataArray.min(dim = 'time')
DataArray.max(dim = 'time')

据我所知,没有内置方法可以以相同方式计算模式。是否有其他方法可以解决此问题,例如借助其他软件包的“帮助”?

也就是说,某些功能等同于:

DataArray.mode(dim = 'time')

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您可以使用Xarray的apply_ufunc包装Scipy的mode函数。 here中提供了更多有关如何使用apply_ufunc的示例。

def _mode(*args, **kwargs):
    vals = scipy.stats.mode(*args, **kwargs)
    # only return the mode (discard the count)
    return vals[0].squeeze()


def mode(obj, None):
    # note: apply always moves core dimensions to the end
    # usually axis is simply -1 but scipy's mode function doesn't seem to like that
    # this means that this version will only work for DataArray's (not Datasets)
    assert isinstance(obj, xr.DataArray)
    axis = obj.ndim - 1
    return xr.apply_ufunc(_mode, obj,
                          input_core_dims=[[dim]],
                          kwargs={'axis': axis})

使用xarray的教程数据集的快速示例:

ds = xr.tutorial.load_dataset('air_temperature')

mode(ds, dim='time')

产量:

<xarray.Dataset>
Dimensions:  (lat: 25, lon: 53)
Coordinates:
  * lat      (lat) float32 75.0 72.5 70.0 67.5 65.0 ... 25.0 22.5 20.0 17.5 15.0
  * lon      (lon) float32 200.0 202.5 205.0 207.5 ... 322.5 325.0 327.5 330.0
Data variables:
    air      (lat, lon) float32 271.5 272.4 272.5 272.1 ... 296.9 296.9 296.79