Question

我正在尝试对数据集进行分位数归一化，但似乎找不到正确的命令。

在python中并没有很多运气。我检查了github上的shawnLYU，但是我无法安装Quantile_Normalize软件包，因为pip似乎找不到它。之后，我决定使用R，并且有一个包preprocessCore，但它说它在我的R版本上不起作用。而且，在文档中它没有说明它支持哪些版本。是的，我已经检查过它是我正在使用的最新版本。请帮我做。

Answer 1

我检查了ShawnLYU的GitHub页面，您可以下载脚本并导入功能。无需pip install。

Answer 2

我制作了一个名为qnorm的软件包，该软件包可以在Python中进行分位数归一化。

import pandas as pd
import qnorm

df = pd.DataFrame({'C1': {'A': 5, 'B': 2, 'C': 3, 'D': 4},
                   'C2': {'A': 4, 'B': 1, 'C': 4, 'D': 2},
                   'C3': {'A': 3, 'B': 4, 'C': 6, 'D': 8}})

print(qnorm.quantile_normalize(df))


         C1        C2        C3
A  5.666667  5.166667  2.000000
B  2.000000  2.000000  3.000000
C  3.000000  5.166667  4.666667
D  4.666667  3.000000  5.666667

有关文档，请参见here。

您可以通过pip轻松安装

pip install qnorm

R中的分位数归一化

2 个答案: