一个用于计算协调数的python程序

时间:2019-05-24 06:14:26

标签: python-3.x

如何从径向分布函数(RDF)配置文件计算配位数?

我正在尝试从溶质-溶剂相互作用的RDF分布图中获得配位数。 rdf数据有两列,分别对应于r vs g(r)。我使用了一个简单的python代码,将g(r)集成到公式的第一个最小值:

Integral =  r^2 * g(r) * dr
CN = 4 * pi * density * Integral

我在dat文件中具有值g(r)。

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