从PDB文件解析

时间:2019-05-20 18:48:46

标签: r statistics protein-database

我必须比较分辨率如何影响DNA结构的手性量,但是我不知道如何从PDB文件中获得该分辨率。分辨率列在“备注”部分,我正在读取带有R的文件,read.pdb函数,但没有给出分辨率。也许有人知道如何从PDB文件中进行解析?

我的输入(它不是完整的输入文件,只是一部分):

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JRNL        DOI    10.1016/J.JMB.2011.12.055                                    
REMARK   2                                                                      
REMARK   2 RESOLUTION.    3.20 ANGSTROMS.   
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我想要的输出:

3.20

文件读取:

file <- read.pdb(fileName, ATOM.only = FALSE, rm.alt=FALSE)

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