Question

我无法上传带有主图像的细分图像治疗后我得到了分割图像（输出测试）主图像和分割后的尺寸不相同的地方但我想将主图像与分段图像结合起来有什么解决办法可以将分割后的图像与主图像进行匹配？

我尝试匹配显示的消息是“分割图像的尺寸与主图像的尺寸不匹配，必须具有相同的尺寸” enter image description here

Answer 1

您可能需要将图像重新采样为与原始图像相同的大小-假设您的分割与输入图像的原点相同，则此功能应该做到这一点。

import SimpleITK as sitk

def resample_image(input_img, input_seg,  is_label=False):
    dimension = 3

    original_spacing = itk_image.GetSpacing()
    original_size = itk_image.GetSize()

    resample = sitk.ResampleImageFilter()
    resample.SetOutputSpacing(original_spacing)
    resample.SetSize(out_size)
    resample.SetOutputDirection(input_img.GetDirection())
    resample.SetOutputOrigin(input_img.GetOrigin())
    resample.SetTransform(sitk.Transform(dimension, sitk.sitkIdentity))
    resample.SetDefaultPixelValue(input_img.GetPixelIDValue())

    if is_label:
        resample.SetInterpolator(sitk.sitkNearestNeighbor)
    else:
        resample.SetInterpolator(sitk.sitkBSpline)

    return resample.Execute(itk_image)

如何修复nifti图像尺寸以匹配？

1 个答案: